哈尤溪發源於中央山脈南段把里志山西南側的巴尤池，向西流入屏東縣霧臺鄉後蜿蜒而行，滙集南側多條支流後轉北再轉西北，滙集北側大支流後轉西再轉西南，再滙集南側支流後，於大武村、阿禮村交界處注入隘寮北溪。源頭巴尤池是原住民魯凱族兩大聖地之一，該溪中段有炫麗的彩色岩壁，近年來成為知名景點。